現時確診新冠肺炎的人士，或與其密切接觸者的家中有飼養哺乳類動物，如貓或狗，有關寵物會被送往漁護署轄下的港珠澳大橋口岸動物居留所接受檢疫。漁護署回覆財務委員會為審批開支預算時透露，截至2月，被送到港珠澳大橋口岸動物居留所及新界南動物管理中心接受檢疫及獸醫學監察的哺乳類動物共有338隻，其中17隻動物，包括9隻狗及8隻貓對病毒測試呈陽性反應。

署方指，至今並沒有接獲私人執業獸醫有關動物懷疑帶有確診新冠肺炎的呈報，而所有呈陽性反應的動物會在獸醫師監督下進行檢疫及獸醫學監察，獸醫師亦會為相關動物進行反覆測試，直至測試結果呈陰性反應後，才會交還予其主人。至今並沒有交予漁護署進行檢疫和獸醫學監察的動物因感染新冠肺炎而死亡。至於寵物檢疫日數，截至2月，寵物接受檢疫和獸醫學監察最長及最短的時間分別為54日及3日。漁護署又表示，至今沒有接獲懷疑因感染新冠肺炎而被棄養的動物。

除港珠澳大橋口岸動物居留所外，新界南動物管理中心亦用作相關動物檢疫設施。現時，港珠澳大橋香港口岸動物居留所，只用於對病毒檢測呈陽性反應的動物作檢疫和獸醫學監察用途。