在計畫中，乘客如乘搭15條指定路線，下車後到區內27個附設在巴士中途站的八達通機拍卡，即可以劃一以$5.4乘搭區內巴士線。換言之，計畫實施後，乘客於將軍澳即使乘搭往市區或新界路線，只要在將軍澳區內下車，車費只需$5.4。
至於來往西貢至黃石碼頭的路線94，亦新增$6.0短途分段收費，乘客需要在落車前到車頭的八達通機拍卡確認。分段收費不可與其他轉乘優惠同時使用，而乘客在上車繳費至下車後到拍卡機拍卡之間，亦不可以同一張八達通卡進行任何涉及交通工具的交易。
將軍澳/西貢區短途分段收費計劃的16條路線
| 路線 | 路線分段收費範圍 |
| 93K | 寶琳 至 馬游塘村 |
| 94 | 西貢市中心至 麥邊 |
| 95 | 翠林 至 馬游塘村 |
| 98 | 將軍澳工業邨 至 清水灣半島 |
| 98A (包括特別班)、98B、98C、297、297P | 坑口 至 馬游塘村/ 寶康公園 |
| 98D(包括特別班) | 坑口 至 寶康公園 康城站 至 厚德邨 |
| 98P、98S | 康城站/ 康盛花園 至 寶康公園 |
| 290、290A | 彩明 至 馬游塘村 |
| 290B、290X | 康城站/ 將軍澳工業邨 至 馬游塘村 |
