國泰航空、香港快運等航空公司已經削減或取消來往香港的航班，香港航空晚上公布，因應新型冠狀病毒爆發的情況迅速變化，暫停部分來往內地及亞洲航班，直至3月28日。

香港航空2月1日起暫停成都、重慶及貴陽航線； 2月11日起暫停三亞航線；2月14日起暫停杭州航線；2月15日起暫停南京航線。而亞洲方面，馬累2月13日起暫停；岡山2月11日起暫停；米子2月25日起暫停；鹿兒島3月2日起暫停。

同時，港航部分航線臨時調整服務班次至3月28日，來往北京、上海及海口的航線每日1班；來往曼谷每周18班；峇里島每日1班；沖繩、大阪及札幌每日1班；東京每日2班；台北每日2班；首爾仁川每周4班。