《新華社》公布《港區國安法》草案主要內容，大律師公會副主席葉巧琦說，如果律政司處理國安案件的部門需要向「國家安全事務顧問」徵詢意見或接受提點，憂慮律政司既有的司法獨立刑事檢控程序和準則，會受到「國家安全事務顧問」的外來影響。

葉巧琦批評，由行政長官指派法官負責處理危害國家安全案件，對香港的司法獨立破壞相當大，等同是「人治」，質疑只是指派「聽話」的法官處理相關案件。她說，法官只會按法律原則審理案件，沒有理由由司法機構以外的某一個人，指定某一個法官才能審理某一類案件，破壞一直以來、行之有效由終審法院首席法官，根據法律才能指派法官的制度。

另外，中央在特定情形下對極少數危害國家安全案件行使管轄權，葉巧琦擔心，寫法並不清晰，質疑草案未有介定何為「極少數」，「公署」是否受香港法律規管，所指的「管轄權」是否包括執法權等。