政府籌備推出粵港澳三地互認「健康碼」，立法會議員莫乃光就計劃的詳情及市民病歷等私隱問題提出質詢。食物及衞生局長陳肇始回覆時表示，系統只會收集申請者的基本個人資料和核酸檢測結果，而系統與流動裝置在傳送數據時亦會作加密處理。她又指，當局已為「健康碼」徵詢私隱專員公署的意見，同時委聘獨立第三方進行私隱影響評估和資訊保安風險審計，以確保私隱保障和資訊安全。

陳肇始表示，為配合先導計劃的推展，特區政府其中一項準備工作是開發「香港健康碼」系統，可將本港參與先導計劃人士的病毒檢測結果上載該碼。檢測結果呈陰性的合資格人士，在離港前可使用智能手機或流動裝置，透過瀏覽器接達電子平台，在網上申請「香港健康碼」並下載於相關手機或裝置。有關程序不涉及額外安裝流動應用程式。

她又指，為配合三地的邊境管制人員互認檢測結果，參與先導計劃人士可自行選擇將「香港健康碼」轉換至廣東或澳門的「粵康碼」或「澳康碼」系統，作入境廣東或澳門的健康申報用途。

陳肇始說，「香港健康碼」的電腦系統只會收集申請者的基本個人資料和核酸檢測結果，作申請「香港健康碼」的用途。開發過程以保障個人私隱為前提，轉碼程序亦須由申請人明確提出及同意，電腦系統與流動裝置在傳送數據時會作加密處理，以確保安全。特區政府已為「香港健康碼」徵詢個人資料私隱專員公署的意見。同時，亦會委聘獨立第三方進行私隱影響評估和資訊保安風險審計，並確保系統及數據轉換的過程符合《個人資料（私隱）條例》（第486章）的規定和香港特區政府的資訊科技保安政策及指引。她續稱，待三地政府完成商討先導計劃工作後會盡快公布詳情。

為便利粵港澳三地居民跨境活動，政府正推展健康碼互認計劃。三地居民如持有由指定醫療機構於七天內發出的2019冠狀病毒病核酸檢測陰性證明，可在入境時獲豁免接受14天強制檢疫。