《港區國安法》草案中提及行政長官應當指定法官，負責處理危害國家安全犯罪案件，引起關注。基本法委員會委員、港大法律學者陳弘毅接受深圳衛視訪問時指，社會存在爭議的國安法案件法官選擇問題，與司法獨立沒有關係。

陳弘毅表示，社會存在爭議的國安法案件法官選擇問題，與司法獨立沒有關係。他續指，司法獨立是指審理案件過程中，法官不受任何干預，以及在法官任命制度中，保證法官在被任命後，長期任職至退休，法官不需要擔心在判決某個案件後被罷免。他又指，相信現有的法官都奉行司法獨立的原則，都是獨立的審案，並指從現有法官中選一部分有資格審理國安法案件的法官，相信這些法官也秉持司法獨立原則，所以認為設立法官名單不會影響司法獨立。

他又指，所有香港法官都是由特首任命，根據《港區國安法》草案説明，新做法是特首從現有法官中任命部分法官，成為有資格審理國安法案件的法官，主要考慮是未必所有法官都適合審理國安法案件。他舉例指，部分為外籍法官，亦有部分法官專門擅長民商法，而不是刑事法等，但指並不表示由特首就每一個國安法案件，特別指定交由哪一個法官審理，特首只是任命一批法官組成一個法官名單。他亦指，市民應該有信心，名單上的法官審理國安法案件時，都會像審理其他案件一樣，秉持司法獨立的原則。