非編碼RNA(核糖核酸)被普遍認為是表觀遺傳調控的重要因子,與不少疾病形成有關。城市大學研究團隊開發嶄新檢測方法,能檢測活細胞內與非編碼RNA結合的蛋白質,新技術有望應用於癌症診斷與幹細胞研究,亦有助找出治療新型冠狀病毒的潛在藥物靶點。

城大生物醫學系副教授嚴健、張亮與陳居明共同領導的「以CRISPR輔助檢測RNA與蛋白質相互作用」(CARPID)新技術,借助現時最先進的基因編輯技術CRISPR/dCasRx系統導航,找出目標RNA,再運用鄰近生物素標記技術,找出活細胞中RNA與蛋白質的相互作用。研究結果早前已在科學期刊《自然方法》上發表。

新技術應用範圍廣泛,嚴健舉例指,新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)便是RNA病毒之一,一旦細胞受病毒感染,可通過新技術檢測該病毒在其生命周期中,與哪些細胞蛋白結合,如能夠減少結合蛋白的數量,或可抑制病毒複製,從而有助找出潛在的抗病毒藥物靶點。

研究團隊嘗試將新方法應用於幹細胞研究外,檢測可在活細胞中進行,在生理狀態下完全恢復RNA與蛋白質之間的相互作用;同時能靈敏地檢測出任何長度或濃度的RNA結合蛋白,而大部分現有方法僅應用於較長的非編碼RNA。