一名菲傭早前完成強制檢疫後確診新型肺炎，入院時的抗體測試已屬陽性。華大基因被指因為採樣不當，未能在一名感染變種病毒的菲傭檢疫期間驗出病毒。醫學會傳染病顧問委員會聯席主席曾祈殷表示，多數個案是受感染後10日才出現抗體，他估計，菲傭有機會在酒店檢疫期間染疫。他又指，若採樣機構未能驗出病毒，需調查採樣員的採樣方法是否符合水平，建議增加酒店檢疫人士的檢測次數。

曾祈殷在電台節目表示，如果菲傭在檢疫期間接受檢測時，採樣員沒有用拭子來回掃多次以套取黏膜細胞，或者未能碰到帶病毒的地方，有機會出現未能得出陽性結果的情況。他又說，菲傭在酒店要接受兩次檢測，惟兩次都出現陰性結果，情況令人擔心。他認為，應考慮安排來自高危地區的旅客接受更多檢測。

曾祈殷說，如華大能理順工作流程、人手等事項，相信這間機構能繼續為香港服務，亦應認同華大過往表現。他強調，接種疫苗是應對疫情的中長期策略，但檢測不可以停，以避免社區爆發隱形傳播鏈。他續指，政府暫停委派華大基因服務流動採樣站，相信是要挽回市民信心。