公營醫療系統在本港的防疫工作中擔當重要角色。特首林鄭月娥在《施政報告》表示，本港的醫療制度仍有不足之處，大力發展基層醫療和推動醫社合作是刻不容緩。

林鄭月娥表示，在過去21個月的抗疫工作中，所有確診的市民和人士都能在醫院獲得適切治療，顯示本港醫療系統的高效專業和快速應變能力。她指，本港的醫療制度仍有不足之處，須在多個範疇作出改善，以應對人口老化對醫療服務帶來的挑戰，其中大力發展基層醫療和推動醫社合作是刻不容緩。

她指，經過數年努力，政府於葵青、深水埗、黃大仙、屯門、南區及元朗設立或即將設立地區康健中心，亦已於另外11區設立地區康健站。食衞局已着手全面檢討基層醫療健康服務及管治架構等方面的規劃，以期為香港基層醫療健康服務制訂可持續發展藍圖，其中加大醫社合作將是重要的一環。

她續指，新冠疫情為全球公共衞生當局帶來極大挑戰，香港也不例外。政府會就過去21個月的抗疫經驗作階段性總結，並考慮加強衞生署在制訂和實施公共衞生策略、監管和促進醫療科技及藥物研發等方面的核心功能，以提升該部門在應對未來社會和公共衞生發展的能力。