疾管署急性傳染病組組長楊靖慧表示，因應武漢不明原因肺病，疾管署已於1月2日發函各醫療院所，針對嚴重肺炎，且發病前10日內曾有武漢地區之旅遊史；或是病人出現發燒及呼吸道症狀，且曾去過武漢的華南海鮮批發市場。醫護人員必須進行通報採檢。與會專家認為應擴大醫療院所的通報標準，避免漏網之魚。
即日起14日內自武漢地區到台灣民眾，若出現發燒及出現咳嗽、流鼻水、喉嚨痛、或是肺炎等呼吸道症狀者，會要求儘速就醫，一律由醫生通報採檢。檢驗端方面，將納入包括MERS、SARS等共26項針對不明原因肺炎的檢驗項目。
台大醫院兒童感染科主治醫生李秉穎表示，若台灣發生疫情，如果能於上述26項針對既有疾病的檢驗方式可檢出，可較為安心，但若是上述檢驗方法無法檢出的新型病毒，則要考慮其他方法，並需加強主動檢驗措施。
至於治療面，李秉穎表示，治療不明原因肺病目前沒有特效藥，多為支持性療法為主，另會以免疫球蛋白酶抑制劑、抗病毒藥物利巴韋林等合併使用，多方嘗試來抑制病毒。
