中國疾病預防控制中心對事件作出以下回應：
一、論文是根據截至2020年1月23日上報的425例確診病例（包括15名醫務人員）所做的回顧性分析，所有病例在論文撰寫前已向社會公佈。論文中提及的15名醫務人員感染病例，分別由國家衛健委高級別專家組組長鍾南山院士於1月20日晚、武漢市衛健委於1月21日凌晨向社會公佈。
二、論文提出的「2019年12月份即在密切接觸者中發生了人際傳播」的觀點，是基於425例病例流行病學調查資料做出的回顧性推論。
三、論文是由來自中國疾病預防控制中心、湖北省疾病預防控制中心、香港大學等十幾個單位的專業人員共同完成。
四、及時在學術刊物發表調查結果，有助於國內外專業同行及時瞭解疾病的特徵，共同評估和研判疫情，改進防控策略。
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據早前報道，該研究報告通過對武漢市截至本月22日的共425宗新冠肺炎確診患者進行分析，得出的結論是：有證據表明，自上月中旬以來，密切接觸者之間已發生人際傳播。「總之，我們發現武漢現階段的新冠肺炎病例倍增時間約爲7.4天。密切接觸者之間的人際傳播從12月中旬開始已經發生，並在此後一個月內逐漸播散。」論文寫道。
而武漢市衛健委的通報曾在上月31日、本月5日和11日三次稱「調查未發現明顯人傳人現象」。直到16日，武漢衛健委通報才稍改措辭稱，現有的調查結果表明，「尚未發現明確的人傳人證據，不能排除有限人傳人的可能，但持續人傳人的風險較低」。
