深圳市第三人民醫院表公布，發現一名患者的糞便中，檢測出新型冠狀病毒核酸檢測呈陽性，指新型冠狀病毒可能可以存在糞便中。深圳市第三人民醫院昨晚（1日）公布，該院肝病研究所研究發現，在某些新型冠狀病毒感染的肺炎確診患者的糞便中，檢測出2019-nCoV核酸（新型冠狀病毒）陽性，很有可能提示糞便中有活病毒存在，醫院的研究人員正做進一步分離病毒的研究。武漢大學人民醫院和中科院武漢病毒研究所隨後證實，曾在患者的肛門與糞便中，發現病毒核酸。 

隨後生態環境部深夜緊急印發通知，部署醫療污水和城鎮污水監管工作，規範醫療污水應急處理、殺菌消毒要求，防止新型冠狀病毒通過糞便和污水擴散傳播。要求地方各級生態環境部門要高度重視醫療污水和城鎮污水監管工作，切實做好醫療污水收集、污染治理設施運行、污染物排放等監督管理；及通知明確，已發生疫情的地方，當地生態環境部門要指導督促相關醫療機構對污水和廢棄物進行分類收集和處理，做到穩定達標排放。 

武漢有臨床醫生指出，針對患者的嘔吐物、糞便等，必須做好個人防護；至於在家隔離的輕症患者，要盡可能避免與家庭成員共用廁所。