在逾一個月的抗疫行動中，檢疫中心不時出現醫療輔助隊隊員的蹤影，他們身兼多職，直至目前已提供多達九百人次的護送服務。跟其他紀律隊伍不同的，是他們各有正職，自願加入抗疫隊伍，醫療輔助隊總參事黃英強表示，部分在通宵當值後，早上還要接着上班。對於港府將以包機接載滯留湖北省的港人，黃稱已有心理準備作出協助，相信隨着對病毒認識加深，可招募更多隊員加入自願隊伍，應付情況。

在今次抗疫行動中，醫療輔助隊在不少環節也有參與，現時每日有超過七十人分三更當值。除了於檢疫中心和檢疫營負責為隔離人士探熱，輔助隊收到衞生署通知後，亦會接送隔離人士入檢疫中心，若內地到港人士沒有香港居所，還會接送至檢疫營，目前已提供超過九百人次的護送服務；而在早前長康邨康美樓居民深夜撤離行動，以及「鑽石公主號」港人包機返港的過程中，醫療輔助隊都有提供協助，一同陪伴乘車到隔離地點；隊員更曾為十多名的家居檢疫人士，到醫院或診所取藥。