台灣總統蔡英文周三(20日)就職前夕，總統府秘書長陳菊宣布，周三後不再續任總統府秘書長。蔡英文回應時則指，感謝陳菊陪伴她與執政團隊度過最艱難的那段日子。

陳菊晚上在社交網站發文指，今年1月在蔡英文帶領下，守著台灣的民主自由與改革成果，向全世界證明台灣人的智慧與勇敢，在台灣即將邁向新階段的此時，她認為，蔡英文需要更大的空間，作最好佈局，因此選擇離開工作了兩年的總統府，並感謝蔡英文的信任及支持。

她又指，過去兩年跟隨總統渡過最艱難的關頭，也看到許多年輕世代，熱情投入公共事務，承擔民主的重任。社會充滿著希望與活力，並指對台灣的未來深具信心。她亦指，在離開前要感謝蔡英文對她的信任和支持，也感謝總統府所有工作夥伴的努力與合作，一起實現對台灣人民的承諾。她續指，未來仍然會和大家站在一起，不忘初衷，守護深愛的土地，追求一個沒有恐懼、沒有威脅的美好社會。

蔡英文回應時則指，這兩年多「真的讓菊姐辛苦了」，並感謝陳菊陪伴她與執政團隊度過最艱難的那段日子，並指「多虧了她，我們才能克服許多困難，重新站穩腳步」。蔡英文又指，「雖然感到不捨，但最後還是只能尊重她的意願，因為我也可以感受到她這些日子所承擔的這麼多，這些都讓人很心疼」。

另外，台灣媒體指，監察委員將由總統提名，因此認為蔡英文在周三就職後，可望正式提名陳菊接任監察院長。