北京疫情反彈，引發第二波疫情爆發的憂慮。對於病毒從何而來，中國疾控中心流行病學前首席專家曾光透露，病毒基因測序的初步結果顯示，北京這次疫情中的病毒毒株不像是國內流行的類型，初步判斷是歐洲新冠病毒變種。同為首席專家的吳尊友則表示，批發市場內被新冠病毒污染的海產品或肉類是源頭的可能性比較大。 
 
吳尊友表示，批發市場很多海産品多冷凍儲存，病毒能夠存活很長時間，傳染人的幾率也更大。他認爲，此宗疫情的源頭可能是批發市場裡，被新冠病毒污染的海産品或肉類。另外，新發地市場人流量非常大，來自四面八方的出入人員也可能是傳染源。但根據北京目前的狀況，第一種情況可能性更大。 
 
曾光認為此次病毒來源有三種可能，一是來自國外；二是北京本土；三是國內其它地區。他著重強調了第一種可能，但最終確定這次北京疫情的新冠病毒究竟是不是本土病毒，需要更多樣本測試結果，「目前已經做了兩例樣本檢測，還要繼續擴大檢測，這對判斷疫情走向有很重要的作用」。 
 
他又指，北京疫情正在接受全國疫情相對平靜後最大的一次考驗，「如果處理不好，會形成第二波疫情」。不過他認為，此次北京對於疫情的處理與武漢初期疫情相比有很大進步，發現早，行動快，而且能認真聽取專家意見。 
 
不少專家對北京控制疫情表示樂觀。國家衛健委高級別專家組成員李蘭娟近日也表示，只要把所有的感染源都找到了，「不要有遺漏就不會大爆發」。《聯合早報》引述新加坡傳染病專家梁浩楠表示，武漢的情況不會重現北京，並形容中國目前是「世界上應對冠病准備最充分的頭號國家」。他認爲，中國官方反應迅速，民眾抗疫意識和配合度也高，要控制病毒傳播相對容易。而國務院副總理孫春蘭召開國務院聯防聯控機制會議時表示由於對病毒變異、傳播規律等未完全掌握，境外疫情仍在蔓延，防控任務仍然艱巨繁重，各地區部門必須時刻繃緊疫情防控這條弦，慎終如始抓好外防輸入、內防反彈工作。