世衞組織於2020年12月31日晚間，通報了新冠病毒發現主要4種變種病毒。世衞組織強調，雖然初步評估英國和南非發現的變種病毒不會增加嚴重性，但其會導致更高的發病率，產生更多住院及死亡病例，所以需要採取更嚴格的公共衞生措施來遏制傳播。

世衞指，2020年1月底至2月初發現「D614G」突變，逐漸取代了最初發現的毒株。到6月該變種成為全球主要傳播的新冠病毒類型。研究表明，與初始毒株相比，該變種的感染性和傳播能力都更高，但不會引起更嚴重症狀，也不會影響現有的檢測、治療、疫苗和公共衞生措施的有效性。

8至9月，丹麥發現一種與水貂相關的病毒變種，被丹麥命名為「Cluster 5」。根據丹麥進行的初步研究，該變種可能減少自然感染或接種疫苗後所產生的抗體保護的程度和持續時間，評估仍在進行。目前丹麥僅在9月發現了12宗人體感染變種病毒，似乎未廣泛傳播。