日本政府早前表示，由巴西抵達日本的航班中，有旅客被驗出一種不同於英國新冠變種病毒的全新變種病毒。目前仍不清楚其傳染力、重症程度，及對疫苗的有效性影響等等，當局正在進行調查。

有網民恐怕日本的新變種病毒，會演變成英國的疫情跡象，「英國自變種病毒出現後，疫情一發不可收拾，每天的確診數字達至五位數，相當嚴峻。日本又有新的變種病毒出現，當地的疫情控制情況，可能會急轉直下。」

另外，日本發現新變種病毒後，已有當地民眾希望取消東京奧運會，有網民憂慮日本或會再延遲東奧，「東京奧運是全球的體育盛事，去年已經因疫情而延後一年，現在疫情持續爆發，又出現新型病毒，東京奧運極有可能會再延遲。」