日本政府厚生勞動省表示，截至5月30日為止，日本境內約有976萬人接種輝瑞疫苗，當中有7人接種第二劑輝瑞疫苗後出現心肌炎及心包膜炎等症狀，年齡介乎20多至60多歲，主要是男性。但當局不認為會對疫苗接種造成影響，當地專家也呼籲民眾積極接種疫苗。

7人中有6人是男性，都是在完成第二劑疫苗接種後出現上述症狀。厚生勞動省認為，這種情況不致於會有對疫苗接種計畫造成影響的重大憂慮，將持續蒐集海外資訊。

專長心臟內科的日本慶應大學教授福田惠一表示，因病毒感染引發心肌炎一旦重症化將攸關生死，必須非常留意，但這次的疫苗內並沒有病毒，研判應該是身體免疫反應造成的心臟發炎。但疫苗引發的症狀，不會比病毒造成的來得嚴重。

福田認為，從目前已知疫苗接種後出現心肌炎頻率及症狀來看，感染新冠病毒造成心肌炎的風險，要比接種疫苗高出許多；接種疫苗的優點大大超越可能風險，民眾仍應積極接種疫苗。