衞生署衞生防護中心公布，由於在8月27日有兩抵港航班，分別為菲律賓航空營運由菲律賓馬尼拉抵港的PR300，及土耳其航空營運由土耳其伊斯坦布爾抵港的TK083，各有三名乘客經抵港檢測而確診新冠肺炎，衞生署遂引用《預防及控制疾病（規管跨境交通工具及到港者）規例》（第599H章）禁止上述兩間航空公司營運的客機在8月29日至9月11日期間，分別從馬尼拉和伊斯坦布爾着陸香港。
　　
另一方面，就貨船Asia Energy及Thor Monadic的營運人涉嫌於向衞生署申請自由無疫通行證時提供虛假資料，衞生署已就船隻的營運人懷疑違反《預防及控制疾病規例》（第599A章）通報警方。調查仍在進行中。