保安局以支聯會涉干犯《香港國安法》罪行及與外國政治性組織有聯繫為由，引用《公司(清盤及雜項條文)條例》第360C條的權力，建議將其從公司登記中剔除。保安局就事件回覆表示，局長鄧炳強考慮了警務處處長的建議和提供的資料後，認為禁止有關組織運作或繼續運作，是維護國家安全、公共安全及公共秩序所需，將向行政長官會同行政會議建議，行使《公司（清盤及雜項條文）條例》第360C條下的權力，命令公司註冊處處長將支聯會自公司登記冊中剔除。

保安局局長向行政長官會同行政會議作出建議前，給予支聯會機會，書面申述為何不應自公司登記冊中剔除，保安局局長收到任何申述後，會連同其建議提交行政長官會同行政會議，以供考慮是否命令將支聯會的公司登記剔除。

當局又指，有關要求與維護國家安全的執法工作相關，而個案最終會交由行政長官會同行政會議考慮，因此不能提供進一步細節，重申必定會繼續根據「有法必依、執法必嚴、違法必究」的嚴謹態度，積極處理涉嫌危害國家安全的組織及調查其他相關組織。